Trabajo que puede servir de guía para alumnos de la UdeC
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% Overleaf (WriteLaTeX) Example: Molecular Chemistry Presentation
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% Source: http://www.overleaf.com
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% In these slides we show how Overleaf can be used with standard
% chemistry packages to easily create professional presentations.
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% Feel free to distribute this example, but please keep the referral
% to overleaf.com
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% How to use Overleaf:
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% You edit the source code here on the left, and the preview on the
% right shows you the result within a few seconds.
%
% Bookmark this page and share the URL with your co-authors. They can
% edit at the same time!
%
% You can upload figures, bibliographies, custom classes and
% styles using the files menu.
%
% If you're new to LaTeX, the wikibook is a great place to start:
% http://en.wikibooks.org/wiki/LaTeX
%
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\documentclass{beamer}
% For more themes, color themes and font themes, see:
% http://deic.uab.es/~iblanes/beamer_gallery/index_by_theme.html
%
\mode<presentation>
{
\usetheme{Boadilla} % or try default, Darmstadt, Warsaw, ...
\usecolortheme{default} % or try albatross, beaver, crane, ...
\usefonttheme{serif} % or try default, structurebold, ...
\setbeamertemplate{navigation symbols}{}
\setbeamertemplate{caption}[numbered]
}
\usepackage[english]{babel}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage{chemfig}
\usepackage[version=3]{mhchem}
\usepackage{subcaption}
\usepackage{caption}
\usepackage{ragged2e}
\usepackage{textpos}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
% On Overleaf, these lines give you sharper preview images.
% You might want to `comment them out before you export, though.
\usepackage{pgfpages}
\pgfpagesuselayout{resize to}[%
physical paper width=8in, physical paper height=6in]
% Here's where the presentation starts, with the info for the title slide
\title[Seminario]{Expression profiling and gene ontology analysis in fathead minnow (\textit{Pimephales promelas}) liver following exposure to pulp and paper mill effluents}
\author{Shannon \textit{et al}.,2012.}
\institute{}
\date{28 de Mayo, 2018}
\begin{document}
\begin{frame}
\includegraphics[scale = 0.35]{banner.png}
\titlepage
\end{frame}
\addtobeamertemplate{frametitle}{}{%
\begin{tikzpicture}[remember picture,overlay]
\node[anchor=north east,yshift=2pt] at (current page.north east) {\includegraphics[height=1cm]{biologo.png}};
\end{tikzpicture}}
%-----------------------------------------------------------------------------
\section{Introducción}
\begin{frame}{Introducción}
\begin{itemize}
\item Contaminación debido a la producción de celulosa\\
\item La compleja matriz de compuestos\\
\item la dificultad de relacionar el agente causante a nivel molecular de los efectos fisiológicos en las especies afectadas.
\end{itemize}
\end{frame}
\subsection{Hipótesis y Objetivo}
\begin{frame}{Hipótesis y Objetivo}
\begin{block}{Hipótesis}
\justifying{Los diferentes estados de los efluentes originados en la industria de la celulosa inducen cambios en la expresión del transcriptoma vinculado a procesos biológicos.}
\end{block}
\begin{block}{Objetivo}
\justifying{Caracterizar los perfiles de expresión genética en el hígado de carpas machos y hembras expuestas a efluentes provenientes de la industria de la celulosa y usar herramientas ontológicas de genes para identificar los procesos biológicos que se ven afectados.}
\end{block}
% The LaTeX wikibook is also a good source of info, e.g.
% http://en.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Chemical_Graphics
\end{frame}
\section{Metodología}
\subsection{Metodología}
\begin{block}{Animales y tratamientos}
\begin{itemize}
\item \textit{Pimephales promelas}
\begin{figure}
\centering
\includegraphics[width=0.3\textwidth]{pez.jpg}
\end{figure}
\item UTK - TK - CMO
\item 10\% (v/v) UTK, 25\% (v/v) TK, 100\% (v/v) CMO o solo agua de río
\item 15 días aclimatación - 6 días con tratamientos
\item Se removieron los hígados mediante disección y se almacenaron a -80°C
\end{itemize}
\end{block}
%----------------------------------------------------------------------------
\begin{frame}[fragile]
\begin{itemize}
\item Extracción ARN
\item Análisis mediante microarreglo
\begin{block}{Bioformática}
\begin{figure}
\captionsetup[subfigure]{justification=centering}
\centering
\begin{subfigure}{0.4\textwidth}
\includegraphics[width=\textwidth]{fff.png}
\caption{Agilent}
\label{fig:ProDy}
\end{subfigure}
\begin{subfigure}{0.3\textwidth}
\includegraphics[width=\textwidth]{r.jpeg}
\caption{R}
\label{fig:evol}
\end{subfigure}
\end{figure}
\end{block}
\item rtPCR - qPCR
\end{itemize}
\end{frame}
%---------------------------------------------------------------
\section{Resultados}
\begin{frame}{Primers}
\begin{figure}[h!]
\caption{Primers utilizados en qPCR}
\centering
\includegraphics[width=1\textwidth]{primers.png}
\end{figure}
\end{frame}
%----------------------------------------------------------------------
\begin{frame}{}
\begin{figure}[h!]
\caption{Diagrama de Venn que representa la diferencia en la expresión de genes en machos y hembras}
\centering
\includegraphics[width=0.4\textwidth]{Diagrama_.png}
\end{figure}
\end{frame}
%---------------------------------------------------------------------
\begin{frame}{Headmap}
\begin{figure}[h!]
\caption{Cluster jerárquico de expresión genética}
\centering
\includegraphics[width=0.8\textwidth]{heatmap.png}
\end{figure}
\end{frame}
%----------------------------------------------------------------
\begin{frame}{GO- Procesos biológicos}
\begin{figure}[h!]
\caption{Procesos biológicos alterados por la exposición a \textit{riles}}
\centering
\includegraphics[width=0.8\textwidth]{GO.png}
\end{figure}
\end{frame}
%---------------------------------------------------------------------
\begin{frame}{Regulación positiva - Procesos biológicos}
\begin{figure}[h!]
\caption{Procesos biológicos alterados por la exposición a \textit{riles}}
\centering
\includegraphics[width=0.8\textwidth]{go_1.png}
\end{figure}
\end{frame}
%----------------------------------------------
\begin{frame}{qPCR}
\begin{figure}[h!]
\caption{Expresión de genes en machos de carpas expuestos a tratamientos}
\centering
\includegraphics[width=0.5\textwidth]{males.png}
\end{figure}
\end{frame}
%------------------------------------------------
\begin{frame}{qPCR}
\begin{figure}[h!]
\caption{Expresión de genes en hembras de carpas expuestas a tratamientos}
\centering
\includegraphics[width=0.4\textwidth]{female.png}
\end{figure}
\end{frame}
%------------------------------------------
\section{Conclusión}
\begin{frame}{Conclusión}
\begin{itemize}
\item
\justifying {El estudio está aportando evidencia de que los residuos industriales líquidos provenientes de la industria de la celulosa afectan la expresión de genes que tiene relación con la reproducción en el hígado de machos y hembras de los peces estudiados.}
\end{itemize}
\end{frame}
\end{document}